影响甲状腺癌预后的因素有很多，主要的有病理类型、临床分期、年龄、性别和治疗是否恰当等。
1)病理类型
分化好的乳头状癌和滤泡样癌是属于低度恶性癌肿，预后良好，如果治疗及时和合理，绝大部分患者可望治愈。但未分化癌则不然，其属于高度恶生的癌肿，发展快，预后差。除少数发现早、治疗及时、手术彻底或获得10年生存率外，绝大部分患者在1~2年内死亡。髓样癌的恶性程度介于上述两种癌肿之间，如果诊治及时，手术彻底，10年生存率可达82%，反之预后也不佳。
2)临床分期
原发灶分期是影响预后的第2位重要因素，一旦原发灶向外浸润，预后就明显不佳，国、内外资料基本一致。
3)性别年龄
国外多数学者也认为女性病人预后较男性好。年龄的因素也很重要，无论男女患者，随着年龄的增加，其生存率逐步下降;即使在同样病期，年轻人的预后还是比年长者的要好。
4)根治程度
虽然大部分甲状腺癌预后较好，但治疗彻底与否仍决定预后的一个重要因素。
