在最新研究里,工作在Station ALOHA(美国夏威夷欧胡岛北部100千米的深海研究地点)的研究人员观察到不同的自由生活的异养细菌物种会在略微不同的时间启动昼夜循环基因,这暗示着每一天微生物群落都会发生一波转录活动。
这项观测利用了高级微生物群落RNA测序技术,后者使得一次对多个物种的整个基因组测序变为可能。这项研究是由美国蒙特利湾水族馆研究所和德隆的研究小组合作进行的,他们使用了空间自由漂浮机器人环境样品处理器(ESP)作为位于Station ALOHA的生物海洋学中心:研究与教育(C-MORE)研究巡航的一部分。ESP位于微生物所处的同一海洋气流里,这使得它能够获得对微生物群落动态性的高频率时间分辨分析所需的样本。
“我想说它们都处于和谐状态,” 带领这项发现的美国麻省理工学院小组负责人、美国夏威夷大学马诺分校的海洋学教授爱德华·F·德隆(Edward F. DeLong)这样说道。“对于任何一个特定物种而言,特定新陈代谢通道的基因记录会在每天同一时间打开,这暗示了某种暂时的划分,”德隆说道,他是夏威夷大学在夏威夷创新计划赞助下的第一名科学家。“这是与生物学和生物地球化学相关的一项新结果。”
科学家所观测到的比较有趣:不同的细菌物种会在不同但始终如一的循环里表达不同类型的基因,例如开启夜间重建收集太阳能所需的修复性基因,然后增加不同基因活动以建造新的蛋白质。“这种规律性和单个微生物活动的定时有点类似小时工日复一日的轮班。”德隆说道。
不同海洋微生物物种基因协调性的定时开启可能对海洋能量转化有着重要的启示意义。海洋微生物与海洋健康和产量密切相关,协调这种周期性的机制仍有待研究。