基于数字证书的应用角度分类，数字证书可以分为以下几种：
服务器证书
服务器证书被安装于服务器设备上，用来证明服务器的身份和进行通信加密。服务器证书可以用来防止欺诈钓鱼站点。
数字证书颁发过程图示
在服务器上安装服务器证书后，客户端浏览器可以与服务器证书建立SSL连接，在SSL连接上传输的任何数据都会被加密。同时，浏览器会自动验证服务器证书是否有效，验证所访问的站点是否是假冒站点，服务器证书保护的站点多被用来进行密码登录、订单处理、网上银行交易等。全球知名的服务器证书品牌有GlobalSign，Verisign，Thawte，Geotrust等。
SSL证书主要用于服务器(应用)的数据传输链路加密和身份认证，绑定网站域名，不同的产品对于不同价值的数据和要求不同的身份认证。
最新的高端SSL证书产品是扩展验证（EV）SSL证书。在IE7.0、FireFox3.0、Opera9.5等新一代高安全浏览器下，使用扩展验证VeriSign（EV）SSL证书的网站的浏览器地址栏会自动呈现绿色，从而清晰地告诉用户正在访问的网站是经过严格认证的。
电子邮件证书
电子邮件证书可以用来证明电子邮件发件人的真实性。它并不证明数字证书上面CN一项所标识的证书所有者姓名的真实性，它只证明邮件地址的真实性。
收到具有有效电子签名的电子邮件，大家除了能相信邮件确实由指定邮箱发出外，还可以确信该邮件从被发出后没有被篡改过。
另外，使用接收的邮件证书，大家还可以向接收方发送加密邮件。该加密邮件可以在非安全网络传输，只有接收方的持有者才可能打开该邮件。
个人证书
客户端证书主要被用来进行身份验证和电子签名。
安全的客户端证书被存储于专用的usbkey中。存储于key中的证书不能被导出或复制，且key使用时需要输入key的保护密码。使用该证书需要物理上获得其存储介质usbkey，且需要知道key的保护密码，这也被称为双因子认证。这种认证手段是目前在internet最安全的身份认证手段之一。key的种类有多种，指纹识别、第三键确认，语音报读，以及带显示屏的专用usbkey和普通usbkey等。
目前的数字证书在广义上可分为：个人数字证书、单位数字证书、单位员工数字证书、服务器证书、VPN证书、WAP证书、代码签名证书和表单签名证书。
