RDKit | PD/PD-L1抑制活性化合物指标分析
RDKit | 基于SSSR区分环状化合物和链状化合物
导入库
from rdkit import rdBase, Chemfrom rdkit.Chem import AllChem, Draw, Descriptors, PandasToolsimport pandas as pd
载入数据
df = pd.read_csv(PD1_inhibitor_dataset.csv)
计算描述符
PandasTools.AddMoleculeColumnToFrame(df, smiles)df[MW] = df.ROMol.map(Descriptors.MolWt)df[MolLogP] = df.ROMol.map(Descriptors.MolLogP)df[NumHDonors] = df.ROMol.map(Descriptors.NumHDonors)df[NumHAcceptors] = df.ROMol.map(Descriptors.NumHAccep