三代测序之微生物基因组 de novo 测序
-05-20编辑:诺禾致源
微生物基因组de novo测序
产品优势
•单分子,长序列,完美跨越细菌全部重复单元
•真菌 20Kb 文库,70× 数据组装,组装效果直达准染色体级别
•个体比较加进化分析,多角度挖掘基因组编码内涵
•多样化的专业后续分析方案,一步到位直奔研究目标
研究方案
研究案例
单分子实时测序技术绘制结核分枝杆菌复合群甲基化图谱
结核分枝杆菌复合群(MTBC)引起的肺结核是遗留的最常见的感染性疾病之一。作者利用单分子实时测序技术完成了来自 MTBC 不同谱系12个菌株的基因组测序和甲基化位点解析(如图4)。
图4 三代修饰图在细菌基因组中的应用
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甘蔗鞭黑粉菌完成图及其与甘蔗的互作转录组
甘蔗鞭黑粉菌是甘蔗的一种常见真菌病原体,作者使用 PacBio 测序平台对菌株进行测序,组装至59条 Contig 的准染色体级别,并基于近缘参考基因组构建了菌株的染色体序列(如图5)。
图5 三代真菌准染色体组装案例
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