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FCN全卷积网络模型——高分辨率遥感影像地物识别

时间:2021-03-10 12:30:08

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FCN全卷积网络模型——高分辨率遥感影像地物识别

FCN全卷积网络模型——高分辨率遥感影像地物识别

这是一篇操作日记

win10与ubuntu的caffe安装过程独立,只是两次不同系统下的演习,真正实验在ubuntu下完成。

操作空间

win10

1:Anaconda 2.0

2:Visual Studio

3:caffe

4:python2.7

Ubuntu 16.04

cuda8.0

cudnn5.1

caffe

win10 python接口配置

本人之前未曾进行过相关学习,搜索到/zb1165048017/article/details/52980102这篇blog,其中配置步骤十分详细。

经测试而知,anaconda安装完成。

1.生成pycaffe

在vs里生成pycaffe后发生错误如下:

错误110error LNK1104: 无法打开文件“python27.lib”D:\caffe\caffe-master\windows\caffe\LINKcaffe错误111error C2220: 警告被视为错误 - 没有生成“object”文件C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\v10.0\include\cuda_fp16.h11pycaffe修正办法:将Anaconda 3.0卸载改为2.0(别忘记修改CommonSettings里的版本),重新编译Pycaffe,任然出现错误:错误35error C2220: 警告被视为错误 - 没有生成“object”文件C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\v10.0\include\cuda_fp16.h11pycaffe突然想起来,pycaffe的属性没有改变c/c++的 “将警告视为错误”没有改为“否”。改正后运行成功。![pycaffe生成成功](https://img-/0128215849483.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk,shadow_10,text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L3FxXzQxMTM2NTUx,size_16,color_FFFFFF,t_70)

2.import caffe

使用win+R 打开命令行,输入cmd回车。有很多不懂的错误…

开学后重拾FCN配置工作,在另一篇博主那里发现,其实应该是在anaconda里打开对应的python exe,然后>>>import caffe。

结果,当然是一堆错误啦(死亡警告~)

Traceback (most recent call last):File "<stdin>", line 1, in <module>File "D:\Anaconda2\lib\site-packages\caffe\__init__.py", line 1, in <module>from .pycaffe import Net, SGDSolver, NesterovSolver, AdaGradSolver, RMSPropSolver, AdaDeltaSolver, AdamSolverFile "D:\Anaconda2\lib\site-packages\caffe\pycaffe.py", line 15, in <module>import caffe.ioFile "D:\Anaconda2\lib\site-packages\caffe\io.py", line 8, in <module>from caffe.proto import caffe_pb2File "D:\Anaconda2\lib\site-packages\caffe\proto\caffe_pb2.py", line 6, in <module>from google.protobuf.internal import enum_type_wrapper**ImportError**: No module named google.protobuf.internal

出现这个错误,就直接打开dos,输入C:\windows\system32>*conda install protobuf*

它提示我 :

“‘conda’ 不是内部或外部命令,也不是可运行的程序或批处理文件。”

这应该是Anaconda没有装好的错误。

在重装了Anaconda2.0后,一切变得快又方便,所以安装这一步真的很重要,版本信息是否和其他软件匹配也必须注意!(之前装的cudnn版本太高,还没降,瑟瑟发抖…)

import caffe后不成功,便第一时间想到是没有装protobuf 在dos端(有的博主说要转到Anaconda Scripts目录下执行)直接 使用conda install protobuf(有博主说这个不行切换为pip install protobuf也可以,但是我这里试了后发现不行,就两个都装了)

在Proceed那里,突然暂停了,等了好久也没反应,按了回车才出现的。

回到Anaconda2里的python.exe,执行import caffe 没有报错,也没有其他信息提供给我,算是成功了?

![import caffe(https://img-/0308132356230.png)

接下来下载FCN放在caffe目录下,测试一张图片,识别率0.92.

上面只是在ubuntu正式训练之前的预热,因为那时候导师还没有给我台式机的使用权~~。

win10安装双系统ubuntu16.04

安装过程直接百度,需要准备一个可格式化的U盘,至少20G吧。

安装ubuntu的电脑是办公室台式服务器,只有它才带的动我的模型啊~~~

按照教程下载Ubuntu16.04LTS、U盘制作软件rufus、设置系统启动模式的EasyBCD,需要可留言,网盘似乎有存档。

分割磁盘大概需要200-300G(前提是内存有那么大),如果只是拿来玩玩100G也够,这里分盘需要记住每个盘大概多大,不行就截个图,后面EasyBCD启动需要用到。

重启后疯狂点击某个键(不同电脑打开方式不同,有F8,F1,F2等)打开bios,设置从U盘启动。

and,第一次一定要设置语言为English,不然后面安装caffe时第一步禁用nouveau会乱码,不习惯英文,安装完caffe之后再切换也没关系的。

ubuntu下配置caffe

大致包括这几个步骤:安装依赖包 、禁用 nouveau 、配置环境变量 、下载 CUDA 8.0

、安装 CUDA 8.0 、验证 CUDA 8.0 是否安装成功 、安装 cudnn 、安装 opencv3.1 、安装 caffe

大致参考的/yhaolpz/article/details/71375762这篇文章,其中会有报错,一个个解决就Ok。

ps…open cv、pycaffe notebook 可以不装,相应地,Makefile.config 里的屏蔽也可以不取消。

caffe中配置FCN

将下载的FCN模型放置在caffe目录下,个人习惯备份一份原始代码在硬盘上。

labelme影像贴图

贴图之前要将影像裁剪为一样大小(128x128或256x256或512x512),本人使用的arcGIS的splitRaster工具,将影像裁为256x256的jpg格式图像。

数据集按照3:7分为验证集和训练集,使用rename.py对图像全部重命名,注意:python中不允许有中文字符出现,即使是注释也不行!

#coding:utf-8import ospath = "...\Users\Administrator\Desktop\train"#替换为自己的目录filelist = os.listdir(path) count=0 #从0开始 for file in filelist: Olddir=os.path.join(path,file) if os.path.isdir(Olddir): continuefilename=os.path.splitext(file)[0] filetype=os.path.splitext(file)[1] Newdir=os.path.join(path,'train_'+str(count).zfill(4)+filetype)#输出目录+文件名+filetype文件类型os.rename(Olddir,Newdir)print('train_'+str(count).zfill(4)) #这里记得把print出来的文件名全部复制到一个txt文件中去,后面fcn模型中train和test需要用到!count+=1input()

输出结果为“train_0000.jpg”、“train_0001.jpg”…

本人下载的label是最简单版本的,安装过程与/wangxiaocvpr/p/9997690.html大致相同,为了方便操作,该插件是在本人笔记本上安装的,直接使用命令端调用labelme,具体安装过程请移步百度。

贴图完成后会生成json文件,我一般打开labelme后就会把output_dir和input_dir设置好,点击自动保存按钮,因为有时候贴图超过图片所在范围labelme就会崩掉,下一次打开记录仍然在,且直接点击next就可以切换到下一张。

json_to_dataset.exe,原本的代码是一个个转的,这里贴出本人的批量转换代码:

import argparseimport base64import jsonimport osimport os.path as ospimport PIL.Imageimport yamlfrom labelme.logger import loggerfrom labelme import utilsdef main():logger.warning('This script is aimed to demonstrate how to convert the''JSON file to a single image dataset, and not to handle''multiple JSON files to generate a real-use dataset.')parser = argparse.ArgumentParser()parser.add_argument('File')parser.add_argument('-o', '--out', default=None)args = parser.parse_args()files = os.listdir(args.File)for i in range(0,len(files)):print(files[i])json_file = os.path.join(args.File,files[i])if args.out is None:out_dir = osp.basename(json_file).replace('.', '_')out_dir = osp.join(osp.dirname(json_file), out_dir)else:out_dir = args.outif not osp.exists(out_dir):os.mkdir(out_dir)data = json.load(open(json_file))if data['imageData']:imageData = data['imageData']else:imagePath = os.path.join(os.path.dirname(json_file), data['imagePath'])with open(imagePath, 'rb') as f:imageData = f.read()imageData = base64.b64encode(imageData).decode('utf-8')img = utils.img_b64_to_arr(imageData)label_name_to_value = {'_background_': 0}for shape in sorted(data['shapes'], key=lambda x: x['label']):label_name = shape['label']if label_name in label_name_to_value:label_value = label_name_to_value[label_name]else:label_value = len(label_name_to_value)label_name_to_value[label_name] = label_valuelbl = utils.shapes_to_label(img.shape, data['shapes'], label_name_to_value)label_names = [None] * (max(label_name_to_value.values()) + 1)for name, value in label_name_to_value.items():label_names[value] = namelbl_viz = utils.draw_label(lbl, img, label_names)num=os.path.splitext(files[i])[0] ###split the file count[i] --> 0030.json to 0030 and .jsonPIL.Image.fromarray(img).save(osp.join(out_dir, 'img.png'))utils.lblsave(osp.join(out_dir, num+'.png'), lbl)###输出贴图png文件名与json文件名相同PIL.Image.fromarray(lbl_viz).save(osp.join(out_dir, 'label_viz.png'))with open(osp.join(out_dir, 'label_names.txt'), 'w') as f:for lbl_name in label_names:f.write(lbl_name + '\n')#logger.warning('info.yaml is being replaced by label_names.txt')info = dict(label_names=label_names)with open(osp.join(out_dir, 'info.yaml'), 'w') as f:yaml.safe_dump(info, f, default_flow_style=False)logger.info('Saved to: {}'.format(out_dir))print('Saved to: %s' % out_dir)if __name__ == '__main__':main()

之前参考了一些其他博主的批量转换,结果是错的,融合图的图例会变成1:0background、2:4 0100、3:2 0200 这样(0100、0200是我的标签名),实际应该是下图这样:

不过这里本人有个疑问:labelme使用json_to_dataset后我的标签图是8位彩色,并非其他博主说的8位灰度图,不知道是不是labelme更新了版本?参考github给出的labelme代码说明,贴图label也是彩色的。

FCN模型训练及测试

本人是仿照voc数据集制作的,将测试集(包括:jpg原图+png贴图)放在pascal/voc目录下对应位置,训练集放在sbdd/banchmark/benchmarkRelease目录下对应位置,其中,sbdd需要新建,banchmark文件需要下载,下载地址 /s/1bhPulA6M4fXZH9Nl3yfCYA mm:i9st

将上面rename.py后复制的图片文件名复制到相应的训练集train.txt、验证集seg11valid.txt中去,在训练的时候会调用该文件夹来读取图片。

另外,不知道大家有没有把图片从win10复制到ubuntu下拓展名变成大写JPG的情况,反正我是有,写一个bat文件,放在win10的图片文件夹下跑一遍就Ok了。

超参数、分类数、迭代次数和权重获取方式等都是按照自己的情况修改。

net.py文件中有个计算平均RGB的地方,看有的博主修改了,有的没有修改,在此奉上从别人那里借鉴的计算代码:

import osfrom PIL import Image import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npfrom scipy.misc import imread filepath = '/home/zjhzwhj/caffe/-master/data/sbdd/benchmark/benchmark_RELEASE/dataset/img' pathDir = os.listdir(filepath)R_channel = 0G_channel = 0B_channel = 0for idx in xrange(len(pathDir)):filename = pathDir[idx]img = imread(os.path.join(filepath, filename))R_channel = R_channel + np.sum(img[:,:,0])G_channel = G_channel + np.sum(img[:,:,1])B_channel = B_channel + np.sum(img[:,:,2])num = len(pathDir) * 256 * 256 R_mean = R_channel / numG_mean = G_channel / numB_mean = B_channel / numprint("R_mean is %f, G_mean is %f, B_mean is %f" %(R_mean, G_mean, B_mean))

修改好net.py中的num_output=21的地方和数据集地址后,运行python net.py,train.prototxt、val.prototxt会相应改动,不需要自己手动修改!

其他也没什么好说的,需要详细教程的可以参考这一篇的后半部分:/zoro_lov3/article/details/74550735

summary

受到样本数据集太小的影响,加上我用的影像光谱分辨率不够高,即使用了fine-tune,精度最高也只有0.60,与预期效果相差甚远,但也算是一次caffe小小实践。训练+数据处理前后耗时大半个月,年前配置caffe耗费一个星期,安装双系统对本人来说也是一个未知领域,算是给大学生活留下最后一笔财富,前两天提交了毕业论文终稿,接下来就是答辩啦,请叫我过儿!!!

第一次开博,写得不够好,一些地方也只是个人理解,望各位大佬多多批评指正!

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