熏蒸消毒的优点是熏蒸的药物气体能均匀地分布到禽舍的各个角落以杀灭物体表面和空气中的病毒、细菌及细菌的繁殖体、芽孢等的病原体，切断传染源和传播途径，阻止疾病的继续传播蔓延。为了充分发挥熏蒸消毒的作用，确保消毒效果，禽舍熏蒸消毒时应注意以下九个方面。
1消毒前做机械性清除
要充分发挥消毒药物的作用，必须使药物与病原微生物直接接触，但被消毒的现场常存在大量的有机物，如粪便、饲料残渣、羽毛碎屑等，这些有机物中含有大量的病原微生物。同时，消毒药物与有机物尤其与蛋白质有不同程度的亲和力，可结合成不溶性的化合物，并阻碍消毒药物作用的发挥。再者，消毒药被大量的有机物所消耗，大大降低了对病原微生物的作用浓度。因此，彻底进行机械清除是有效消毒的前提条件。
2禽舍要密闭完好
熏蒸消毒时气体中药物含量越高，消毒效果越好。为了防止气体溢出舍外，在熏蒸消毒之前，一定要检查禽舍的密闭性，对门窗无玻璃或不全者装上玻璃，若有缝隙，应贴上塑料布；报纸或胶布带，尽可能地密封好，以防漏气。
3盛放药物的容器要耐腐蚀、耐热、体积大
如高锰酸钾和福尔马林具有腐蚀性，混合后反应剧烈，释放热量，一般可以持续10～30分钟，因此盛放药品的容器应足够大，并耐腐蚀、耐热。
4药物的剂量、浓度和比例要适合
福尔马林与高锰酸钾的比为2：1。一般福尔马林30ml/立方米，高锰酸钾15g/立方米。
5提供适宜的温度和湿度
病原微生物的生长繁殖需要一定温度和湿度。一般舍温不低于15℃，相对湿度以60%～80%为好，不宜低于60%。当舍温不低于26℃，相对湿度在80%以上时，消毒效果较好。
6配合其他的消毒方法
熏蒸消毒只能对物体的表面进行消毒，所以熏蒸之前应进行机械性消毒和喷洒消毒，这样消毒效果会更好。
7消毒的方法适当，确保人禽安全
操作时，先将水倒人陶瓷容器内，然后加入高锰酸钾，均匀搅拌，再加入福尔马林，人即离开，密封禽舍。用于熏蒸的容器应尽量靠近门。以便操作人员能迅速撤离。操作人员要避免甲醛与皮肤接触，消毒时必须空舍。
8维持一定的消毒时间
要熏蒸24小时以上；如不急用，可密闭2周。
9熏蒸消毒后逸散空气
消毒后禽舍内甲醛气体较浓，有刺激性，因此要打开禽舍门窗，通风换气2天以上，等甲醛气体完全消散后再使用。如急需使用时，可用氨气中和甲醛（按空间用氯化铵5g/立方米，生石灰10g/立方米，75℃热水10ml/立方米，混合后放入容器内，即可放出氨气。30分钟后打开禽舍门窗，通风30～60分钟即：可进入禽舍。
