（一）低收入
随着传统零售业结构的改变，跨境电商进口行业已经对消费者产生了重大影响。由于国内境内市场已经相对饱和，电商进口企业无法提供较高的增长空间，从而使电商进口企业想要实现更高收入的可能性大大降低。
（二）贸易保护问题
由于跨境电商交易存在跨局域性贸易壁垒，从而导致其存在不同程度的贸易保护政策介入，影响着跨境电商进口市场的发展。通过实施贸易保护政策，有助于促进国家国内行业、消费者和国际合作伙伴之间的利益关系，但同时也会限制跨境电商进口平台在海外及国内推广营销的基础上的自由度。
（三）物流方面的不便
物流渠道扩展需要耗费巨大的金钱和其他资源，随着国际物流渠道的发展，跨境电商进口平台面临着诸多不便，例如受国家管制的海关政策，运费应用支付等等，这些都会限制跨境电商进口公司提高盈利能力的空间。
（四）技术和培训层面的投入
跨境电商进口平台在建立和运营过程中，企业管理层需要做出的资源投入很大，这就要求企业必须拥有技术水平和创新能力，而这些也需要企业通过投入保证公司的发展和提升品牌效益。
（五）安全和风险管理方面的投入
当货物由海外运输到中国时，跨境电商进口平台必须重视服务安全，采取必要的措施，以确保顾客得到良好服务质量。与此同时，跨境电商进口企业也需要尊重客户的合法权益，充分保护用户的隐私权。此外，企业还需要为避免风险投入一定的精力，以保证交易数据的安全，建立完善的安全机制。
（一）履约能力不足：
由于跨境电商进口平台的交易模式是全线上的，因此买家只能了解实际情况，而不是整个进口过程的具体进度，重复询问可能较难获得真实信息，影响买家对销售商的信任。此外，跨境电商进口平台上的运输过程也比传统进口更加复杂，容易出现报关拖延等问题，增加买家的疑虑。
（二）支付的复杂性和风险：
由于跨境电商进口平台的模式，买家考虑到风险因素，会要求销售商使用支付宝等支付工具和信用担保的服务进行支付，而不是现金支付。因此，销售商除了要提供多种支付方式和折扣外，还需要提供以上服务，这增加了销售商的费用，使得价格会变得更高，在运维上也增加了销售商的负担。
（三）服务能力较弱：
由于跨境电商进口平台的交易格局，客服的及时服务处理能力要求更高，如售前技术支持、质量管理等，因为线上咨询的模式，无法进行实体服务或紧急解决问题，提供的服务仅限于发送文档和解答一般性问题，不能一对一接待，无法立即解决客户的问题，客服能力较弱。
（四）经营范围受限：
跨境电商进口平台运营的具体范围，受国家政策和法规的制约，国内市场对海外商品的购买也存在偏好的变化，进入跨境电商进口平台的外国商品数量有限，经营范围受限，营销上并不是所有商品都能在跨境平台上有良好的展示效果，这使销售商有限，影响购物者以及购买决策，制约跨境电商进口平台零售业的发展。
（五）安全性较低：
由于跨境电商进口交易的全网上模式，买家的数据传输和支付安全等都有可能存在风险，虽然有双方关注，但是跨境电商进口平台的安全水平相比传统的渠道还是较低的，这些问题会给买家带来不便，隐私也可能遭受侵害，可能会因此造成多样的损失后果。
