小男孩乔乔加入了青年团，在军事训练营里，他被要求杀死一只兔子来培养残忍之心。可是善良的乔乔于心不忍，被当众取笑，并得到了乔乔兔（Jojo rabbit）的绰号。在他迷茫困惑的时候，他敬仰的人生导师希特勒总会来到他身边开导他，帮他驱散迷雾，放飞自我。于是他勇敢地抢过手榴弹扔到树上，再弹回自己脚下炸花了自己的脸。
他妈妈鼓励他走出门去，找队长得到了张贴小广告的任务。在广场上，他们看到了一排被绞死示众的人。他怯怯地问妈妈，他们做了什么。妈妈沉重地说，做了他们该做的事。
他们该做的事是什么呢？没有解释。这需要乔乔自己去找答案。
然后，他在自己家里楼上发现了一个暗室，里边竟然藏着一个犹太女孩！窝藏犹太人可是重罪啊，当务之急是赶走她，可以他的小身板又办不到，他还不敢让妈妈知道，只说是姐姐的鬼魂或是老鼠在活动。
如果妈妈知道一个犹太人躲在自己家里她会有什么反应呢？她可最清楚其中的利害，一定会马上报告党卫军，来证明自己的清白和忠诚吧。
然而真相是，犹太女孩就是妈妈藏起来的。妈妈处心积虑瞒着他，因为在妈妈眼里，他是个不可理喻的极端分子！这么说一个十岁的孩子是不是言重了呢？他像只兔子一样温顺、胆怯，却在脑子里把元首当作至高偶像崇拜着，不难想象，等他长大之后，一定会像那些取笑过他的大兵们一样，意气风发义无反顾地踏上杀人的战场。他此时的怯懦和周围同龄者的勇敢和服从相比，已经是落后了。妈妈相信他还保留着纯真的希望，不想看到自己仅剩的孩子沦为另一个鬼魂——善良的灵魂被邪恶、残暴的意念所吞噬，那确实可以算是鬼魂了。
要想不成为鬼魂，只有用自己的善良与周遭貌似的无比强大的邪恶对抗。邪恶也许可以煊赫一时，但绝不会成为最后的胜者。
乔乔得知是妈妈在保护犹太女孩（死去的姐姐的朋友），他的怨恨和愤怒在滋长，他不能容忍亲近的人背叛祖国，于是他们在餐桌上发生激烈冲突，他们都到了心理防线的边界，幸亏亲情及时到场，才挽救濒临崩溃的母子关系。这不是一场灌输观念的戏，却让乔乔在去恶向善的路上稳住阵脚。
他和犹太女孩在游戏中渐渐缓和关系，他们共同完成一部介绍犹太人的画册，通过这个东西，他对犹太人也渐渐有了区别于纳粹教给他的那一套的全新认知，原来真实的犹太人并非恶魔，倒是有点可爱。这时，意念中的元首跳出来，告诫他不要被旁人摆布。这是一种内心纠结的外化，他的小心脏正被两股力量撕扯着。
秘密警察突然登门，秘密眼看就掩藏不住了。犹太女孩竟敢以姐姐的身份站到警察对面，这也许是最冒险也是最安全的方式了。凭借她的勇气、巧合的幸运和画册造成的误解，当然还有良知未泯者的同情，他们转危为安。
妈妈一直没有回家，等乔乔在广场上看到妈妈的那双鞋时，穿鞋的人已经吊在绞刑架上了。这个女人的美丽不仅在于她的妙曼身体和活泼个性，更在于她对正义的坚持与牺牲。作为一名地下工作者，她的戏份不算多，但她出场的每一秒都没有浪费。过去这对母子有很深的隔阂，妈妈为了他的安全，也因为他不能理解，所以一直没有告诉他自己在干什么。即使是带路党的一员，妈妈也是他身心的依靠。妈妈的离去让他意识到纳粹才是真正的敌人，他最好的朋友告诉他，背着人民干了很多坏事的元首已经开枪自杀了。他的三观彻底改变了。
纳粹军队最后负隅顽抗时，它的宣传机器甚至发动黄口孺子扛枪上阵或直接去做人肉炸弹，但是乔乔必须活着，只有让他活着才能让很多人的牺牲有意义。他身上的军服让他被当作了纳粹分子，又是那个良知未泯的人救了他。
十岁半时，乔乔接受了犹太姐姐，学会了系鞋带，把意念中的元首踢出窗外，两人终于可以尽情舞蹈。
片子从童真的视角，以戏谑的方式，表现纳粹对民众特别是孩子的思想控制，以及摆脱这种控制的艰难过程，因为加入了狂欢的手法，丝毫不显得沉闷严肃，却同样引人深思。在这个故事架构里，乔乔的思想转变是明线，民众的觉醒与反抗成为暗线，那个时不时跳出来的元首既承担了讽刺任务，又推动情节，是这个异想世界里不可或缺的人设。
几个角色的设置，基本可以反映魔头希特勒的暴政之下民众的不同立场。受到纳粹思想蛊惑的大多数人，把拥护希特勒的所有政策变成自发行为，心甘情愿参与到纳粹的暴虐行为中，在对世界施暴的同时，也让自己失去人性。反抗者既要承受亲人的不能理解的责难，更要设法躲避无处不在的危险。魔头掌权时，他们如同行走在刀尖上，一不小心就可能被吊死。而良心未泯的少数人，对时局有清醒认识，又要设法保全自己，当他们在力所能及的情况下去保护弱者，甚至为了救别人牺牲自己，他们的形象同样高大。在一个残暴的命令下，士兵开枪是职责，有意打偏才证明他是个人而非机器。
