稍微学术的体验的地方，也是东海大学海洋科学博物馆的推荐点。在水族馆2楼的科学博物馆，可以通过海洋科学大厅和机械水族馆博物馆触摸到海的不可思议。譬如，实际海的研究能挑战的，是被海洋科学大厅设置的海产研究室。“海洋研究室”里陈列着书架和桌子，有助于研究海洋的资料。如果根据想调查的主题自己找到资料，用显微镜观察检身体的话，就能体会到研究者的心情吧。
机器水族馆的，是一边看机器装置的机械装置，一边观察海洋生物的不可思议的运动的角。也有自己操纵机械装置的柜台，可以体验海洋生物的活动。楼层中央的“海洋生物”区域是展示住在海里的各种生物标本的地方。18米以上的金枪鱼天然气鲸的标本等，成为2层楼层的看点之一。
另外，珍贵的大鼠标本也是值得一看的。大鲨鱼是生活在深海里的鲨鱼，但是珍稀性很高，作为“梦幻鲨鱼”被珍视。近年来，东海大学对骏河湾捕获的个体进行了解剖，并制成了标本。面向儿童的体验项目丰富，在东海大学海洋科学博物馆，准备了很多有益于中小学生等儿童教育的体验项目。体验项目基本上是以学校为单位使用的样式。
但是，一般的团体也可以另外收费。10名到30名后的成员可以使用的项目很多，其中有即使人数少的也能使用的项目。譬如，以最小参加人数5人能利用，是「饲养体验」的程序。亲子一起玩耍的熊猫宝宝，也是东海大学海洋科学博物馆的推荐点。水族馆的楼层设置的热带鱼·Kids的角，楼层马特铺设，稍微Kids空间一样的气氛。这个区域设置了可以直接触摸海边的生物的水槽，在孩子们中也很受欢迎。
可以体验了解海星、海参、海胆等触感的宝贵体验。东海大学海洋科学博物馆因饲养海水鱼熊猫而闻名。馆内有展示日本和海外的各种各样的黑眼圈，可以和色彩鲜艳的鱼一起拍照。海啸机制明白海啸实验水槽博物馆外面有海啸实验水槽和波浪水槽。通过这样的设备可以了解海啸发生的机制和波浪的情况，是作为研究机关的东海大学海洋科学博物馆才有的推荐点。
海啸实验水槽在上午和下午进行几次实验。水槽内设置了陆地和海洋的透视画，海啸来袭时的变化可以很容易地看到。能验证根据防波堤的效果和地形的不同波浪的拥挤方法怎样变化，等，成为这边的水槽的看点。设置在海啸实验水槽中的透视画相当大，通过实验体会到海啸的威胁是真正的。
在实演中再现了海底隆起和海底陷落的两种海啸，可以观察到它们的不同。海底隆起的海啸的特征是一口气蜂拥而来。海底陷落的海啸，一旦引水后大浪就会流入陆地。水族馆在全国分布着许多，不过，能看这样的海啸的实演的设施被限定现实。不仅仅是海的美丽和丰富，也能接触到自然的威胁，可以说是这里的东海大学海洋科学博物馆吧。
