病菌主要以菌丝体潜伏于种子内，或以分生孢子附着于种子表面，或以拟菌核和分生孢子盘在落地的病株残体上越冬。翌年，越冬菌源产生分生孢子，借助风雨传播，由寄主伤口和表皮直接侵入，借助气流、昆虫、育苗和农事操作传播并在田间反复侵染。调运未消毒的带菌种子，可以远距离传播此病害。病菌繁殖适温12～33℃，最适温度27℃。空气相对湿度95％以上，分生孢子萌发时侵染能力最强。因此，高温多雨或高温高湿、窝风积水、田间郁闭、长势衰弱、密度过大、氮肥过多以及病毒病发生较重的地块，炭疽病发生也很重。
病菌以分生孢子附于种子表面或以菌丝潜伏在种子内越冬，播种带菌种子便能引起幼苗发病；病菌还能以菌丝或分生孢子盘随病残体在土壤中越冬，成为下一季发病的初侵染菌源。越冬后长出的分生孢子通过风雨溅散、昆虫或淋水而传播，条件适宜时分生孢子萌发长出芽管，从寄主表皮的伤口侵入。初侵染发病后又长出大量新的分生孢子，传播后可频频进行再侵染。
