工藤新一和江户川柯南，是同一个人所持有的不同社会身份。新一是受万千少女欢呼的高中生侦探，柯南则是隐在小兰家追查黑衣组织的帝丹小学生。
柯南连载20余年，故事主线流转时间不到半年。这半年恍如隔世，科学技术发展突飞猛进。科技更新的同时，故事角色随着主线故事的推进也在成长。
柯南在第一集就已变小登场，那时的柯南急切地寻找黑衣组织的下落，想着尽快拿到解药，恢复成工藤新一的身体，重新过上正常人的生活。现在看来，柯南当初的想法颇显稚嫩，急于求成，满是些不成熟心态。
柯南的真实年龄是17岁，这个年龄是孩子与成人的交界年龄，虽非完全无忧无虑，但很多重要烦恼尚未纳入思考的范围。未被世人知晓的a药，突如其来的变故，将现实的美好全部打碎，于是乎命运陡然突转的柯南不得不面对这个世界赤裸裸的残酷。
变小的柯南的生活回到原点，需要再重新审视这个世界了，他拎起儿时书包上学，和小兰只如初见，去结识新的朋友，切割过去必要的联系，小心翼翼地隐藏身份，因为如果让黑衣组织发现柯南真实的身份，柯南和他身边的人都会遭殃。
逆境中的柯南，不仅面临爱情、友情的考验，而且还要克服黑衣组织的恐惧。小兰是否愿意等待？是否有志同道合的伙伴和自己并肩作战？黑衣组织是否坚不可摧？三个新成长的烦恼，三个女人给出了答案。
小兰
柯南曾经做过一个梦，他梦见了后小兰即将和新出医生结婚，他的梦境是他潜意识中对这种遥遥无期等待的担忧。新兰之间的情感是非常让人揪心的，“盈盈一水间，脉脉不得语”是两人最真实的写照。
在没变小之前，新兰也如平次和和叶这对恋人一般，平时嬉笑怒骂，大大咧咧。“新一失踪”后，小兰彻底表达了对新一的眷恋，变小的柯南才真正的意识到这份情感的分量，他的心智也逐渐成熟了，多了包容和珍惜，恢复身体的他往往会因递不出爱情枝丫而懊悔不已。
两人相知相恋相爱相守，这一过程要比常人困难百倍，小兰用不变的真情等待着新一的归来，柯南对小兰的亏歉，只有默默为之赴汤蹈火，不停地追击黑衣组织，一酬最初的约定。
灰原
灰原是柯南非常重要的伙伴。交友莫过知己，灰原是最懂柯南的女孩子。他俩互为依托，柯南是灰原的支柱，灰原性格的蜕变，人生的重拾，离不开柯南的鼓励；灰原是柯南的引路灯，她比柯南成熟，她帮柯南审时度势，时刻提醒不因一时的冲动而忽视了危险的敌人。
灰原的出现，柯南真正有了了解自己内心的人，很多不能说的话他都可以和同病相怜的灰原讲述。借着灰原，柯南踏出了接触黑衣组织的第一步，同时也认清了现实，一个有着半个世纪历史的组织，不可能在一夜间覆灭的，红与黑的碰撞是持久的。既然已经介入了这场战争，耐心和毅力是必须具备的品质。
贝尔摩德
贝尔摩德恐怕是最为复杂的一个人物了，她非红非黑，是唯一一个站在灰色立场的人物。因此，很难用好坏标准去鉴定这个人物。涉及到黑衣组织层面的，无论多么十恶不赦的事她都照着执行不误，但如果是无关组织的，她却是耀眼的，她是受芸芸众生追捧的影星，是帝丹高中标榜的“好医生”，是可以为新兰做任何事情的贝尔摩德。
贝尔摩德对柯南的行为是有影响的，贝尔摩德对柯南的情感为其调查黑衣组织提供强有力的支撑，有一位保护神在组织内部暗中周旋，柯南也心宽了不少。经过与贝姐的接触，柯南了解到黑衣组织内部矛盾也不少，并非坚不可摧的，他不再像以前那般有太多的恐惧焦虑。满月篇是柯南全部了解黑衣组织的开始，在此之后，柯南也不再一个人战斗，他开始联合更多的伙伴，共同对抗黑衣组织。
