九阳神功是阳刚生猛的风格, 和降龙十八掌, 重剑剑法, 杨过海啸掌法十分般配。九阴真经则是郭靖的看家本领，郭靖学会九阴真经以后，把降龙十八掌练到精纯，并且加入了阴柔的一面，而杨过也曾学习过九阴真经，周伯通也是学会九阴真经以后从一个准一流，一下子变成了天下第一。
文中都反复强调，两者都是武功的最高境界，张无忌可能是唯一一个完整读过两部真经的人，他认为，两者都到最高境界后是不相上下的。
从江湖地位上看，九阴真经从来都是江湖争夺的经典，而且争夺九阴真经的都是江湖顶尖武功高手，比如华山论剑的前后两辈五绝。而九阳神功在江湖中籍籍无名，即便是武当、峨眉、少林各得三分之一经书，也从来没想着要合订本，更没有偷到拼抢。而抢夺九阳神功的仅仅是西域两个无名小辈。
而《九阳真经》的作者则改成了一位儒释道三教皆通的奇人。这位奇人本来就对天下武学很有研究，武功并不下于五绝之首的王重阳，他在与王重阳斗酒的时候获胜，因此得以一睹《九阴真经》的内容并默记于心，研究后认为《九阴真经》偏向于阴柔，还是有可以改进的地方，于是自己又创作了《九阳真经》，所以从这个故事设定上看，也应该说《九阳真经》上的武学，特别是内功心法，是要比《九阴真经》更胜一筹的。
