干细胞用于人类疾病的治疗是一个全新且十分有价值的领域，尤其对于消化系统疾病，具有广阔的应用前景。人体消化系统的基本生理功能是摄取、转运、消化食物和吸收营养、排泄废物，为提供机体所需的物质和能量。而干细胞可以分化出消化系统的各种功能细胞，如胃肠道、肝脏的各种功能细胞，用于治疗消化系统疾病。
干细胞治疗肝硬化与肝衰竭
对于慢性乙型肝炎后肝硬化失代偿期或慢性肝衰竭等终末期肝病患者，最有效的治疗手段是肝移植。但由于供肝短缺，费用昂贵，无法满足众多肝衰竭患者的治疗需求，这就要求肝脏病学界探索其他可行的替代治疗手段。而干细胞在肝硬化、肝衰竭等疾病中显示了潜在的疗效。
间充质干细胞能有效地治疗肝衰竭，而且研究人员发现直接用间充质干细胞治疗肝衰竭效果优于用间充质干细胞进行诱导分化后的肝细胞。干细胞治疗肝脏疾病的机制包括转分化为肝细胞样细胞、促进肝再生、免疫调节及抑制肝纤维化。
干细胞治疗炎症性肠病
炎症性肠病作为一种病因尚未明确的慢性非特异性肠道炎性疾病。主要包括溃疡性结肠炎和克罗恩病，其具有终身复发倾向，且重症患者迁延不愈，预后不良。
间充质干细胞用于治疗炎症性肠病的分子机制主要包括迁移归巢、免疫调节及损伤组织修复。研究表明，间充质干细胞可以明显降低促炎因子水平、改善肠道组织病理。
干细胞治疗胰腺炎
急性胰腺炎是临床常见的急腹症之一。在其病理生理过程中,过度激活的白细胞及瀑布样反应的炎性因子释放加速了病情的恶化。增加了治疗的难度.其中10%-20%的患者可发展为重症急性胰腺炎（SAP），SAP病情凶险,临床病死率高。
近年的研究显示间充质干细胞在胰腺组织修复中有重要价值，其自我更新、多向分化潜能、独特的低免疫原性和免疫调节及促进新生血管形成等作用可能为重症急性胰腺炎提供一种全新的治疗方法。可以显着改善胰腺组织病理、降低血清淀粉酶和脂肪酶水平、降低血清促炎因子水平、升高血清抗炎因子水平。慢性胰腺炎是由于各种不同病因引起的胰腺组织和功能持续性损害，最终导致胰腺内外分泌功能永久性丧失。间充质干细胞不仅可以抑制促炎因子，还通过抑制胰腺星状细胞激活、促进其凋亡来减轻胰腺纤维化。
目前干细胞在消化系统的研究与应用主要集中在肝硬化、肝衰竭、急慢性胰腺炎、炎症性肠病等领域。干细胞用于人类疾病的治疗是一个全新且十分有价值的领域，尤其对于消化系统疾病，具有广阔的应用前景。
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