点击蓝字↑↑↑“微生态”，轻松关注不迷路
推荐：江舜尧
编译：Harvey
编辑：小菌菌
中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室何剑锋研究员等人于4月2日在微生物顶级期刊Microbiome发表题目为《Structure and function of the Arctic and Antarctic marine microbiota as revealed by metagenomics》的文章，该研究为更全面地分析全球海洋微生物群落提供基础资料。
文章摘要
研究背景：北极和南极是地球上两个地理距离最远的生物群落。最近的取样工作和宏基因组学研究已经揭示了全球海洋微生物的多样性和功能，但是在全球样品分析中，极地地区的微生物群落还没有被包括在内。方法：本文利用宏基因组测序技术，对来自北极和南极地区28个不同深度的海水样本(n = 60)和来自塔拉海洋的样本进行了研究。结果：在塔拉海洋数据集中，超过7500(19%)个来自极地海水的操作分类学单位无法被识别，超过390,000个蛋白质编码基因标准品在海洋微生物参考基因目录中没有被发现。本研究对214个从极地海水微生物群落中发现的组装基因组(MAGs)进行了分析，发现了在极地地区普遍存在而在温带海水中几乎检测不到的菌株。这些微生物的代谢途径重建表明其在糖类和脂类生物合成、硝酸盐和硫酸盐还原以及二氧化碳固定等方面具有广泛的用途。通过对比发现，北极和南极的微生物群落中，北极的抗生素抗性基因丰富，南极的微生物功能，比如DNA重组等较为丰富。结论：结果发现，在北极和南极海水中存在有占优势及局部富集的微生物的出现，它们具有独特的适应环境的功能特征，本研究为更全面地分析全球海洋微生物群落提供了基础资料。
文中重要图片说明
图1 | 北极(蓝色)和南极(红色)海水的28个采样点的地理分布。
图2 | 60个极地海水样品在门水平上的分类学结构。
图3 | 极地和塔拉海洋微生物群落的Alpha-和Beta-多样性分析。
图4 | 极地微生物组与塔拉海洋数据的比较。
图5 | 基于COG函数的PM-RGC与OM-RGC特异性正交函数的比较。
图6 | 极地和塔拉海海水宏基因组的丰度决定了微生物在极地海水中的富集程度。
图7 |在极地海水中富集的32种微生物的固碳、氮循环、硫循环和脂/糖合成基因。
你可能还喜欢
度回顾 | 微生态环境微生物类微文大合辑
度回顾 | 微生态人体/动物微生物类微文大合辑
度回顾 | 技术贴合辑大放送
微生态科研学术群期待与您交流更多微生态科研问题
（联系微生态老师即可申请入群）。
了解更多菌群知识，请关注“微生态”。
点击阅读原文，免费下载该SCI原文
