由于苏联政府没有公开黑匣子记录的数据，关于86036号伊尔-76坠毁的原因，至今也没有定论。有人认为是阿明的支持者伪装成苏军空管人员，故意引导飞机偏航，致其撞山。这一说法没有足够说服力，首先，苏军是在1979年12月25日进入阿富汗的，但是进攻阿明宫是在27日，这两日间苏军的企图尚未彻底暴露，阿明也并未下令抵抗，因此阿明的支持者干这种事不太可能。
此外，即便真是阿明的支持者伪装成空管人员，为什么当晚飞入阿富汗的数十架飞机中，只有86036号被成功误导，而其他飞机安然无恙，这显然不合情理。也有人认为是86036号伊尔-76是被”圣战者”的便携式防空导弹。这一说法就更不大可能了。因为，在苏军刚入侵阿富汗时，抵抗运动规模还很小，也没有得到西方的大力援助。他们那里来的便携式防空导弹。
要知道，便携式防空导弹进入阿富汗是1984年以后的事情。现在看来，86036号伊尔-76最有可能还是操纵失误导致的坠毁。当晚有数十架伊尔-76、安-12这样的大型运输机在喀布尔机场起降，间隔时间很短。每架飞机刚降落后不久就再度起飞，以腾出跑道。如此短的间隔时间就使得没有足够时间消除其起降造成的涡流，数十架大型运输机起降造成的涡流是惊人的。
86036号伊尔-76很可能被卷入其中，难以操纵，最终撞山。此外，当时的喀布尔机场很简陋，夜间的灯光引导设备不齐全。而喀布尔机场本身又不是那么好降落的一个机场，四周多山。86036号的机组人员很可能在没有足够灯光引导的情况下提前下降高度，导致撞山。
86036号伊尔-76M的坠毁令苏军招致了入侵之初的最大损失。苏军79年在阿富汗一共有86名士兵死亡，86036号伊尔-76M坠机的损失就占到了一多半，可谓悲剧。不过，伊尔-76运输机在入侵行动中的表现总体来讲仍然是成功的，在最短时间内将大量人员和技术兵器运进了阿富汗。在接下来长达9年的阿富汗战争中，伊尔-76运输机继续发挥着至关重要的角色。
1980年冬天，入侵1年以后，伊尔-76再次频繁出现在阿富汗上空。冬季到来，大雪封山，跨越兴都库什山脉的几个关键隘口都无法通行，第40集团军的后勤无法保障。从装备到弹药，再到食物，都急需供应。其中最重要的是食物。因为人民民主党政府按照苏联模式改造阿富汗，不仅没有带来阿富汗经济的增长，反而破坏了阿富汗最重要的农业基础。
结果是苏军入侵之后，阿富汗比以前更急需苏联的食物援助，所以苏军从阿富汗就地取食是根本不可能。一切所需都得从苏联本土运来。陆路交通受阻，只好空运了。那年冬天，每天都有5-6架伊尔-76运输机从土库曼斯坦马拉空军基地飞往阿富汗。当时，阿富汗的机场有大有小。巴格拉姆、喀布尔、坎大哈、马扎里沙里夫、信丹德这几个机场最大，拥有3500米长的混凝土跑道。
而其中只有喀布尔、信丹德和坎大哈这3个机场完全符合伊尔-76的起降要求。昆都士、贾拉拉巴德这两个机场拥有1500 - 1800米长的柏油跑道，可以起降安-12、安-22运输机。阿萨达巴德、加德兹、拉什卡尔加、法扎巴德、赫拉特等省城机场只有几百米长的野战跑道，只有安-26运输机可以起降。因此，军事运输航空兵向阿富汗运输物资的方法是这样的，由伊尔-76把物资运到大机场，再由安-12、安-26继续向各地的小机场运输。
伊尔-76负责从苏联本土向阿富汗运输物资，而阿富汗境内的物资、人员运输，基本上是由安-12运输机和安-26运输机负责的。不过，为了保证前线部队的物资供应，苏联军事运输航空兵的机组有时也会冒险驾驶伊尔-76在更简陋的机场起降。
除了运送后勤物资，伊尔-76有时还承担将重型机械、卡车运往阿富汗的任务，以加强第40集团军的运输能力。1981年起，由于阿富汗境内的抵抗运动规模越来越大，第40集团军更加频繁的作战，物资需求量越来越大，伊尔-76向阿富汗大规模空运已成常态。空运架次的增加令空运的枢纽塔什干机场不堪重负，大量的伊尔-76起降严重干扰了塔什干机场的正常运转。
于是，苏联人决定专门修建负责向阿富汗运输物资的机场，同时，在各个机场部署多支运输机分队，每个分队由6架伊尔-76飞机组成，以胜任运输任务。1983年5月，费尔干纳机场建成。随后，苏军又在距阿富汗边境30千米左右的沙漠边缘地带修建了大量辅助机场，用于向阿富汗运输物资的机场。
