结业考核包括专业理论考核和临床实践能力考核两部分。
其中，专业理论考核部分由人才中心组建34个临床(含口腔)培训专业的题库，各省级卫生计生行政部门可自愿选择与人才中心对接、自国家题库中抽题组卷，也可自行命题组卷。使用国家题库的地区，由人才中心提供人机对话考核技术服务、考核结果分析等指导服务工作，根据考区需求，人才中心可提供通过标准建议。
临床实践能力考核部分，根据国家卫生计生委颁布的《住院医师规范化培训内容和标准(试行)》，由人才中心组织制定各专业临床实践能力考核指导标准，各考区根据该标准制定本地安排并组织实施，可委托医师协会等行业组织、有关单位具体实施。
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