南方医科大学和汕头大学两所学校虽然教研领域不相同，但是两所学校在广东省内知名度都比较高，属于广东省内知名院校。汕头大学是一所多学科并进的综合性大学，而南方医科大学则是以医学为主的专类高校，但是两所学校都是广东省重点大学，实力相对省内高校来讲，还是比较突出的。
南方医科大学，是一所现有附属医院，后有医学院的大学。事实上南方医科大学的附属医院，南方医院实力更强，建院历史更为悠久。南方医院创建于1941年，当时是新四军第三师后方医院，参加过抗日战争，解放战争，抗美援朝等，是一所具有光荣传统的医院。而南方医科大学就是以这所医院为基础组建而成，所以说他是现有医院，后有医学类教育的高校。
南方医科大学，建校之初就是一所中专学校，当时是一所军事建制学校，主要是培养军内中等医护人员而设置的学校。因为这所学校长期隶属于军队，所以在特种医学方面实力比较强，主要是在核生化医学防护领域。另外其在器官衰竭防治，肾脏疾病，疑难病中西结合方向等领域实力极强。这些都是他拿奖的主要领域，南方医科大的院士也主要来自这些领域。
汕头大学是一所综合性大学，不过建校较晚，教学和研究积淀方面略有欠缺，单项优势不明显，整体实力相对比较突出。汕头大学，校内医学比较突出，临床医学，基础医学，药学等方面都不错，但是南方医科大学相比，真就是小巫见大巫了。整体来看，南方医科大学的综合实力胜过汕头大学一些，毕竟南方医科大学影响力更大一些。
