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麻省理工学院的工程师开发的新技术可以使突触中的单个蛋白质成像

时间:2023-07-12 15:52:21

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麻省理工学院的工程师开发的新技术可以使突触中的单个蛋白质成像

麻省理工学院的工程师已经开发出一种技术,使他们能够快速成像突触中的许多不同蛋白质。右下角是其他图像的合成。

我们的大脑包含数百万个突触,这些突触在神经元之间传递信息。在这些突触中有数百种不同的蛋白质,这些蛋白质的功能障碍会导致精神分裂症和自闭症等疾病。

麻省理工学院以及哈佛大学和麻省理工学院的研究人员现在已经设计出一种新方法,可以以高分辨率快速成像这些突触蛋白。使用荧光核酸探针,它们可以标记和成像无限数量的不同蛋白质。他们在一项新研究中证明了该技术,在该研究中他们对包含数千个突触的细胞样品中的12种蛋白质进行了成像。

麻省理工学院生物工程学副教授马克·巴特说:“多重成像很重要,因为即使在同一大脑内,突触与细胞之间也有很大的差异。” “您确实需要同时查看样品中的蛋白质,以了解不同突触的亚群是什么样,发现新型突触,并了解遗传变异如何影响它们。”

研究人员计划在下一步使用这种技术来研究突触在阻断与特定疾病相关基因的表达时会发生什么,以期希望开发出可以逆转这些效应的新疗法。

博德研究所斯坦利精神病学研究中心的转化研究主管Bathe和Jeff Cottrell是该研究的资深作者,该研究今天发表在《自然通讯》上。该论文的主要作者是前博士后Syuan-Ming Ming和Remi Veneziano,前研究生Simon Simon Gordonov,以及前研究科学家Li Li。

DNA成像

突触蛋白具有多种功能。它们中的许多有助于形成突触支架,这些支架与分泌神经递质和处理传入信号有关。虽然突触包含数百种这些蛋白质,但传统的荧光显微镜技术仅限于一次最多成像四个蛋白质。

为了增加这个数字,麻省理工学院的团队基于一种称为DNA PAINT的现有方法开发了一项新技术。使用最初由马克斯·普朗克生物化学研究所的拉尔夫·荣格曼(Ralf Jungmann)设计的这种方法,研究人员使用DNA抗体探针标记了蛋白质或其他感兴趣的分子。然后,他们通过传递与DNA抗体探针结合的荧光DNA“寡核苷酸”使每种蛋白质成像。

DNA链彼此之间固有的亲和力很低,因此它们会定期结合和解除结合,可以使用超高分辨率显微镜对闪烁的荧光进行成像。但是,对每种蛋白质进行成像大约需要半小时,因此无法对大型样品中的许多蛋白质进行成像。

Bathe和他的同事着手创建一种更快的方法,使他们可以在短时间内分析大量样本。为了实现这一目标,他们改变了DNA染料成像探针,使其可以使用所谓的锁定核酸与DNA抗体更紧密地结合。这样会产生更亮的信号,因此可以更快地完成成像,但分辨率略低。

Bathe说:“当我们在单个神经元孔上进行12或15种颜色处理时,整个实验需要一个小时,而与之相比,整夜需要一整夜。”

研究人员使用这种技术来标记突触中发现的12种不同蛋白质,包括脚手架蛋白质,与细胞骨架相关的蛋白质以及已知标记兴奋性或抑制性突触的蛋白质。他们研究的蛋白质之一是shank3,这是一种与自闭症和精神分裂症都有联系的支架蛋白质。

通过分析成千上万个神经元中蛋白质的水平,研究人员能够确定往往比其他蛋白质更频繁地相互关联的蛋白质组,并了解它们所含蛋白质中不同突触的差异。此类信息可用于帮助将突触分类为可能有助于揭示其功能的亚型。“抑制性和兴奋性是典型的突触类型,但据推测,突触有许多不同的亚型,关于它们是什么没有真正的共识,” Bathe说。

了解该疾病

研究人员还表明,他们可以测量神经元用称为河豚毒素(TTX)的化合物治疗神经元后发生的突触蛋白水平的变化,这种化合物可增强突触连接。

“使用常规的免疫荧光法,您通常可以从同一样品中的三个或四个靶标中提取信息,但是通过我们的技术,我们能够将该数量扩展到同一样品中的12个不同靶标。我们将这种方法应用于检查突触重塑, TTX治疗后会发生这种情况,我们的发现证实了以前的工作,揭示了TTX治疗后突触蛋白的协同上调,”该研究的作者,麻省理工学院高级博士后埃里克·丹尼尔森(Eric Danielson)说。

研究人员现在正在使用这种称为PRISM的技术来研究通过敲除与各种疾病相关的基因如何影响突触的结构和组成。对自闭症和精神分裂症等疾病患者的基因组进行测序后,发现了数百种与疾病相关的遗传变异,而对于大多数变异,科学家都不知道它们如何导致疾病。

Bathe说:“了解遗传变异如何影响神经元在大脑中的发育以及它们的突触结构和功能,是神经科学和理解这些疾病如何产生的巨大挑战。”#清风计划##健康真探社#

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